雲林縣97年截至12月31日止，HIV新通報個案52人（毒品病患47人），相較96年通報個案72人（毒品病患65人），95年通報個案數174人，顯示近幾年來在縣府團隊、檢警單位與中央政策的配合下，自兩年前推動『雲林縣毒品病患愛滋減害計畫』包含「預防愛滋衛教諮詢服務計畫」「毒癮愛滋病患美沙冬替代療法計畫」，不但將雲林縣疫情已明顯趨緩，防治上已見成效。

雲林縣衛生局表示，94年通報AIDS病毒感染410人，因注射毒品感染者403人(佔98.29﹪)，其中80人為外縣市於縣轄監獄之受刑人，使得本縣AIDS病毒感染人數遽增，究其原因包括海洛英濫用有逐年上升趨勢，再加上因毒癮者擔心購買針具時遭警方跟監或身上攜帶針具作為檢警辦案證據等誤解而選擇針具共用行為，而毒癮者因對愛滋病認知不足，毒癮發作時無法控制因而產生共用針具或稀釋液等不安全行為，導致愛滋病的患者不斷增加，為本縣縣民、社區、家庭帶來極大的衝擊。

為降低愛滋病所造成的衝擊，縣府團隊也積極合作配合檢警單位及中央政策，除加強安全性行為、全程使用保險套、不共用針具、不共用刮鬍刀、避免不安全輸血、避免不安全刺青等衛生教育宣導，及加強辦理社區毒癮者、性工作者、個案接觸者、毒品施打、吸食等高危險群篩檢外；更自95年7月推動『雲林縣毒品病患愛滋減害計畫』包含「預防愛滋衛教諮詢服務計畫」「毒癮愛滋病患美沙冬替代療法計畫」外，更全國首創推動「美沙冬替代療法社區外展服務計畫」，期能降低愛滋病發生率，以維護縣民健康。

衛生局在97年度共設置了47個衛生諮詢服務站，透過社區藥局、醫療院所、衛生所、義工等提供保險套、消毒棉片、衛生教育諮商及「舊針換新針」免費供應清潔針具等服務，期能提高毒品施用者對愛滋病之認知，減少毒品病患共用針具及稀釋液，並經由擴大宣導提昇民眾對毒癮與愛滋病認知，以達反毒、戒毒、防愛滋之目標。

衛生局也指出，目前本縣列管存活HIV個案577人，服刑在監人數240人（其中非本縣籍者97人），設籍本縣之HIV個案佔83.2﹪；而97年度「美沙冬替代療法」截至97年12月31日，計收案ＨＩＶ（＋）369人，ＨＩＶ（－）1013人；服藥中ＨＩＶ（＋）107人，ＨＩＶ（－）294人。

為提高病人醫療可近性，以台大雲林分院為核心醫院，若瑟醫院、中國醫藥學院北港附設醫院及成大斗六分院為次核心醫院，擔任個案診治醫院，並外展至麥寮、水林、二崙、林內及大埤等五鄉鎮衛生所為毒癮個案投藥點，方便醫療院所轉介毒癮個案就近於週一至週五可至外展服務點服藥，鼓勵個案回歸職場正常生活。